NAME

CracTools::DigitagCT - Cross DGE tag with several data types.

DESCRIPTION

SYNOPSIS

digitagCT extra/toyDGE.sam --gff ensembl.gff

AUTHORS

Jerôme AUDOUX <jerome.audoux@univ-montp2.fr.fr>, Alban MANCHERON <alban.mancheron@lirmm.fr>, Nicolas PHILIPPE <nicolas.philippe@inserm.fr>.

COPYRIGHT AND LICENSE

Copyright (C) 2012-2013 -- IRB/INSERM (Institut de Recherche en Biothérapie / Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale)

FRENCH

Ce fichier fait partie de la suite CracTools qui contient plusieurs pipeline intégrés permettant de traiter les évênements biologiques présents dans du RNA-Seq. Les CracTools travaillent à partir d'un fichier SAM de CRAC et d'un fichier d'annotation au format GFF3.

Ce fichier fait partie du Pipeline de traitement de données NGS de la plateforme ATGC labélisée par le GiS IBiSA.

Ce logiciel est régi par la licence CeCILL soumise au droit français et respectant les principes de diffusion des logiciels libres. Vous pouvez utiliser, modifier et/ou redistribuer ce programme sous les conditions de la licence CeCILL telle que diffusée par le CEA, le CNRS et l'INRIA sur le site "http://www.cecill.info".

ENGLISH

This file is part of the CracTools which provide several integrated pipeline to analyze biological events present in RNA-Seq data. CracTools work on a SAM file generated by CRAC and an annotation file in GFF3 format.

This software is governed by the CeCILL license under French law and abiding by the rules of distribution of free software. You can use, modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL "http://www.cecill.info".