Module Permissions for AJPAGE

Owner of 393 modules, co-maintainer of 2 modules

Module (395) Owner Co-Maintainers
Bio::AssemblyImprovement AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Abacas::DelimiterRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Abacas::Iterative AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Abacas::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::AdapterRemoval::Trimmomatic::Main AJPAGE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::IndexAndCorrectReads AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::PreprocessReads AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Circlator::Main AJPAGE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::DigitalNormalisation::Khmer::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Config AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Iterative AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::IvaQC::Main AJPAGE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::PrepareForSubmission::RenameContigs AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::PrimerRemoval::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Quiver::Main AJPAGE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::Descaffold AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Config AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Iterative AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Main AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::OutputFilenameRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::PreprocessInputFiles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::TempDirectoryRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::FastaTools AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::FastqCleanupRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::FastqTools AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::GetReadLengthsRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::OrderContigsByLength AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::UnzipFileIfNeededRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Util::ZipFileRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AssemblyImprovement::Validate::Executable AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::CommandLine::AnnotateBacteria AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::CommandLine::GeneNameOccurances AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::CommandLine::ParseGenesFromGFFs AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::External::Cmscan AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::GeneNameOccurances AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::GeneNamesFromGFF AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::ParseGenesFromGFF AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::ParseGenesFromGFFs AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::AutomatedAnnotation::Prokka AJPAGE
Bio::AutomatedAnnotation::SpreadsheetOfGeneOccurances AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper::CommandLine::AnnotateEukaryotes AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper::External::LSFInterProScan AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper::External::ParallelInterProScan AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::InterProScanWrapper::ParseInterProOutput AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::MLST::Blast::BlastN AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Blast::Database AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::CDC::Convert AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Check AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::CheckMultipleSpecies AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::CompareAlleles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::DatabaseSettings AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Databases AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Download::Database AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Download::Databases AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Download::Downloadable AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Exceptions AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::FilterAlleles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::NormaliseFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::OutputFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::ProcessFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::SearchForFiles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::SequenceType AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Spreadsheet::File AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Spreadsheet::Row AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Types AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Validate::Executable AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Validate::File AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::MLST::Validate::Resource AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::PanGenome AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::AnalyseGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::AnnotateGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ChunkFastaFile AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ClustersRole AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CombinedProteome AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::CreatePanGenome AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::ExtractProteomeFromGff AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::PanGenomePostAnalysis AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::PanGenomeReorderSpreadsheet AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::ParallelAllAgainstAllBlastp AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::PlotPanGenomeGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::QueryPanGenome AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::CommandLine::TransferAnnotationToGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Blastp AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Cdhit AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Makeblastdb AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Mcl AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Muscle AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::PostAnalysis AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::External::Segmasker AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ExtractProteomeFromGFF AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ExtractProteomeFromGFFs AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::FilterFullClusters AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::FilterUnknownsFromFasta AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::GeneNamesFromGFF AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::GroupLabels AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::GroupStatistics AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::InflateClusters AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::JobRunner::LSF AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::JobRunner::Local AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::JobRunner::Role AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::DifferenceBetweenSets AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::GroupMultifasta AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::GroupTabFiles AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::GroupsMultifastaNucleotide AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::GroupsMultifastas AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::GroupsMultifastasNucleotide AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::NumberOfGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::OneGenePerGroupFasta AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Output::QueryGroups AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ParallelAllAgainstAllBlast AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::Plot::FreqOfGenes AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::PostAnalysis AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::PrepareInputFiles AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::ReorderSpreadsheet AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::SampleOrder AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::PanGenome::SequenceLengths AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Generate::Evolve AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Generate::EvolvedSet AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Generate::VCFWriter AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Report::InputParameters AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Report::Overview AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Report::ParseVCFCompare AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Types AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Pipeline::Comparison::Validate::Executable AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Accessions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::EMBL::AccessionLookup AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::EMBL::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::GeneMetaData AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Input::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Input::FileOnePerLine AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Spreadsheet::File AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Spreadsheet::LookupAccessions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::Resistome::Spreadsheet::LookupRow AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::AccessionFile AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::Exceptions AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::LoggingRole AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::RefWeak AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::RemoteSpreadsheetRole AJPAGE VOFFFORD
Bio::RetrieveAssemblies::WGS AJPAGE VOFFFORD
Bio::Roary AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::AccessoryBinaryFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::AccessoryClustering AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::AnalyseGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::AnnotateGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::AssemblyStatistics AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::BedFromGFFRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ChunkFastaFile AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ClustersRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CombinedProteome AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::AssemblyStatistics AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::Common AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::CreatePanGenome AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::ExtractProteomeFromGff AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::GeneAlignmentFromNucleotides AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::IterativeCdhit AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::MergeMultipleFastaAlignments AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::ParallelAllAgainstAllBlastp AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::ProteinMuscleAlignmentFromNucleotides AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::QueryRoary AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::Roary AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::RoaryCoreAlignment AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::RoaryPostAnalysis AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::RoaryReorderSpreadsheet AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::TransferAnnotationToGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::CommandLine::UniqueGenesPerSample AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ContigsToGeneIDsFromGFF AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Exceptions AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Blastp AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Cdhit AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::CheckTools AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Fasttree AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::GeneAlignmentFromNucleotides AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::IterativeCdhit AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Mafft AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Makeblastdb AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Mcl AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Muscle AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::PostAnalysis AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Prank AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::ProteinMuscleAlignmentFromNucleotides AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Revtrans AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::External::Segmasker AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ExtractCoreGenesFromSpreadsheet AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ExtractProteomeFromGFF AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ExtractProteomeFromGFFs AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::FilterFullClusters AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::FilterUnknownsFromFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::GeneNamesFromGFF AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::GroupLabels AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::GroupStatistics AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::InflateClusters AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::IterativeCdhit AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::JobRunner::LSF AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::JobRunner::Local AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::JobRunner::Parallel AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::JobRunner::Role AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::LookupGeneFiles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::MergeMultifastaAlignments AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::OrderGenes AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::BlastIdentityFrequency AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::CoreGeneAlignmentCoordinatesEMBL AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::DifferenceBetweenSets AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::EMBLHeaderCommon AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::EmblGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::GroupMultifasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::GroupsMultifastaNucleotide AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::GroupsMultifastaProtein AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::GroupsMultifastas AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::GroupsMultifastasNucleotide AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::NumberOfGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::Output::QueryGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ParallelAllAgainstAllBlast AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ParseGFFAnnotationRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::PostAnalysis AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::PrepareInputFiles AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::PresenceAbsenceMatrix AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::QC::Kraken AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::QC::Report AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::QC::ShredAssemblies AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ReformatInputGFFs AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::ReorderSpreadsheet AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::SampleOrder AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::SequenceLengths AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::SortFasta AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::SplitGroups AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::SpreadsheetRole AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Roary::UniqueGenesPerSample AJPAGE BEWT SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis AJPAGE BEWT CARLAC SSJUNNEBO
Bio::Tradis::AddTagsToSeq AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Analysis::Exceptions AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Analysis::InsertSite AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CombinePlots AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis::CommandLine::AddTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::CheckTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::FilterFastqTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::PlotCombine AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis::CommandLine::PlotTradis AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::RemoveFastqTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::RunMapping AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::TradisAnalysis AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::CommandLine::TradisBam AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::DetectTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Exception AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis::FilterTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Map AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Parser::Bam AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Parser::Cigar AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis::Parser::Fastq AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::RemoveTags AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::RunTradis AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Samtools AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO VOFFFORD
Bio::Tradis::TradisPlot AJPAGE BEWT CARLAC PUETHE SSJUNNEBO
Bio::VertRes::Config AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaAssemblyAndAnnotation AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaAssemblySingleCell AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::BacteriaSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::Common AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::ConstructLimits AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::EukaryotesAssembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::EukaryotesMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::EukaryotesRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::EukaryotesRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::EukaryotesSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::HelminthMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::HelminthRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::HelminthRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::HelminthSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::LogParameters AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::ReferenceHandlingRole AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::StudyNameSearch AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::VirusAssemblyAndAnnotation AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::VirusMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::VirusRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::VirusRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::CommandLine::VirusSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Exceptions AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::MultipleTopLevelFiles AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::AnnotateAssembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Assembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::BamImprovement AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Bowtie2Mapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::BwaMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Common AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Import AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Mapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::QC AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::RnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Roles::FilenameWithReference AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Roles::MetaDataFilter AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Roles::MultiplePrefix AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Roles::RootDatabaseLookup AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::SmaltMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::SnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::SpadesAssembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Ssaha2Mapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::StampyMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Store AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::TophatMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::Tradis AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Pipelines::VelvetAssembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaAssemblyAndAnnotation AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaAssemblySingleCell AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaMappingUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRnaSeqExpressionUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRnaSeqExpressionUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRnaSeqExpressionUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRnaSeqExpressionUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaRnaSeqExpressionUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaSnpCallingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaSnpCallingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaSnpCallingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaSnpCallingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::BacteriaSnpCallingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Common AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesAssembly AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesMappingUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRnaSeqExpressionUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRnaSeqExpressionUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRnaSeqExpressionUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRnaSeqExpressionUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesRnaSeqExpressionUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesSnpCallingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesSnpCallingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesSnpCallingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesSnpCallingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::EukaryotesSnpCallingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Global AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::HelminthRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::BacteriaMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::BacteriaRegisterStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::BacteriaRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::BacteriaSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::CreateGlobal AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::EukaryotesMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::EukaryotesRegisterStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::EukaryotesRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::EukaryotesSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::Reference AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::RegisterStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::VirusMapping AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::VirusRegisterStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::VirusRnaSeqExpression AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::Roles::VirusSnpCalling AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusAssemblyAndAnnotation AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusMappingUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRegisterAndQCStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRnaSeqExpressionUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRnaSeqExpressionUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRnaSeqExpressionUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRnaSeqExpressionUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusRnaSeqExpressionUsingTophat AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusSnpCallingUsingBowtie2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusSnpCallingUsingBwa AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusSnpCallingUsingSmalt AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusSnpCallingUsingSsaha2 AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Recipes::VirusSnpCallingUsingStampy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::References AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::RegisterStudy AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::TopLevel AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Types AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Validate::File AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio::VertRes::Config::Validate::Prefix AJPAGE BEWT VOFFFORD
Bio_AssemblyImprovement AJPAGE
FaSlice AJPAGE BEWT VOFFFORD