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Bio::AssemblyImprovement
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SSJUNNEBO
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Bio::AssemblyImprovement::Abacas::DelimiterRole
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Bio::AssemblyImprovement::Abacas::Iterative
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Bio::AssemblyImprovement::Abacas::Main
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Bio::AssemblyImprovement::AdapterRemoval::Trimmomatic::Main
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Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::IndexAndCorrectReads
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Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::Main
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Bio::AssemblyImprovement::Assemble::SGA::PreprocessReads
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Bio::AssemblyImprovement::Circlator::Main
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Bio::AssemblyImprovement::DigitalNormalisation::Khmer::Main
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Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Config
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Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Iterative
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Bio::AssemblyImprovement::FillGaps::GapFiller::Main
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Bio::AssemblyImprovement::IvaQC::Main
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Bio::AssemblyImprovement::PrepareForSubmission::RenameContigs
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Bio::AssemblyImprovement::PrimerRemoval::Main
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Bio::AssemblyImprovement::Quiver::Main
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::Descaffold
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Config
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Iterative
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::Main
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::OutputFilenameRole
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::PreprocessInputFiles
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Bio::AssemblyImprovement::Scaffold::SSpace::TempDirectoryRole
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Bio::AssemblyImprovement::Util::FastaTools
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Bio::AssemblyImprovement::Util::FastqTools
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Bio::AssemblyImprovement::Util::OrderContigsByLength
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Bio::AssemblyImprovement::Util::UnzipFileIfNeededRole
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Bio::AssemblyImprovement::Util::ZipFileRole
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Bio::AssemblyImprovement::Validate::Executable
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Bio::MLST::Blast::BlastN
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Bio::MLST::Blast::Database
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Bio::MLST::CDC::Convert
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Bio::MLST::Check
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Bio::MLST::CheckMultipleSpecies
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Bio::MLST::DatabaseSettings
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Bio::MLST::Databases
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Bio::MLST::Download::Database
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Bio::MLST::Download::Databases
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Bio::MLST::Download::Downloadable
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Bio::MLST::Exceptions
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Bio::MLST::FilterAlleles
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Bio::MLST::NormaliseFasta
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Bio::MLST::OutputFasta
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Bio::MLST::ProcessFasta
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Bio::MLST::SearchForFiles
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Bio::MLST::SequenceType
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Bio::MLST::Spreadsheet::File
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Bio::MLST::Spreadsheet::Row
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Bio::MLST::Types
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Bio::MLST::Validate::File
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Bio::MLST::Validate::Resource
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Bio::Roary
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Bio::Roary::AccessoryBinaryFasta
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Bio::Roary::AnalyseGroups
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Bio::Roary::AssemblyStatistics
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Bio::Roary::ChunkFastaFile
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Bio::Roary::ClustersRole
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Bio::Roary::CombinedProteome
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Bio::Roary::CommandLine::AssemblyStatistics
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Bio::Roary::CommandLine::CreatePanGenome
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Bio::Roary::CommandLine::GeneAlignmentFromNucleotides
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Bio::Roary::CommandLine::ProteinMuscleAlignmentFromNucleotides
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Bio::Roary::CommandLine::QueryRoary
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Bio::Roary::CommandLine::Roary
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Bio::Roary::CommandLine::RoaryCoreAlignment
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Bio::Roary::CommandLine::TransferAnnotationToGroups
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Bio::Roary::External::Cdhit
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Bio::Roary::External::CheckTools
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Bio::Roary::External::Fasttree
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Bio::Roary::External::GeneAlignmentFromNucleotides
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Bio::Roary::External::IterativeCdhit
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Bio::Roary::External::Mafft
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Bio::Roary::External::Makeblastdb
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Bio::Roary::External::PostAnalysis
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Bio::Roary::External::Prank
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Bio::Roary::External::ProteinMuscleAlignmentFromNucleotides
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Bio::Roary::External::Segmasker
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Bio::Roary::ExtractCoreGenesFromSpreadsheet
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Bio::Roary::ExtractProteomeFromGFFs
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Bio::Roary::FilterUnknownsFromFasta
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Bio::Roary::GeneNamesFromGFF
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Bio::Roary::GroupLabels
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Bio::Roary::GroupStatistics
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Bio::Roary::InflateClusters
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Bio::Roary::IterativeCdhit
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Bio::Roary::JobRunner::Local
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Bio::Roary::JobRunner::Parallel
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Bio::Roary::JobRunner::Role
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Bio::Roary::LookupGeneFiles
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Bio::Roary::MergeMultifastaAlignments
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Bio::Roary::OrderGenes
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Bio::Roary::Output::CoreGeneAlignmentCoordinatesEMBL
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Bio::Roary::Output::DifferenceBetweenSets
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Bio::Roary::Output::EMBLHeaderCommon
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Bio::Roary::Output::EmblGroups
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Bio::Roary::Output::GroupsMultifastaProtein
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Bio::Roary::Output::GroupsMultifastasNucleotide
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Bio::Roary::Output::NumberOfGroups
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Bio::Roary::Output::QueryGroups
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Bio::Roary::ParallelAllAgainstAllBlast
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Bio::Roary::PostAnalysis
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Bio::Roary::PrepareInputFiles
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Bio::Roary::PresenceAbsenceMatrix
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Bio::Roary::QC::Kraken
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Bio::Roary::QC::Report
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Bio::Roary::QC::ShredAssemblies
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Bio::Roary::ReformatInputGFFs
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Bio::Roary::ReorderSpreadsheet
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Bio::Roary::SampleOrder
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Bio::Roary::SequenceLengths
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Bio::Roary::SortFasta
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Bio::Roary::SplitGroups
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Bio::Roary::SpreadsheetRole
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Bio::Roary::UniqueGenesPerSample
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VOFFFORD
Bio::Tradis
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Bio::Tradis::AddTagsToSeq
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Bio::Tradis::Analysis::Exceptions
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Bio::Tradis::Analysis::InsertSite
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Bio::Tradis::CombinePlots
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Bio::Tradis::CommandLine::AddTags
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Bio::Tradis::CommandLine::CheckTags
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Bio::Tradis::CommandLine::FilterFastqTags
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Bio::Tradis::CommandLine::PlotCombine
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Bio::Tradis::CommandLine::PlotTradis
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Bio::Tradis::CommandLine::RemoveFastqTags
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Bio::Tradis::CommandLine::RunMapping
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Bio::Tradis::CommandLine::TradisAnalysis
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Bio::Tradis::CommandLine::TradisBam
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Bio::Tradis::DetectTags
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Bio::Tradis::Exception
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Bio::Tradis::FilterTags
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SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Map
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SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Parser::Bam
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Bio::Tradis::Parser::Cigar
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SSJUNNEBO
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Bio::Tradis::Parser::Fastq
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SSJUNNEBO
Bio::Tradis::RemoveTags
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SSJUNNEBO
Bio::Tradis::RunTradis
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SSJUNNEBO
Bio::Tradis::Samtools
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SSJUNNEBO
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Bio::Tradis::TradisPlot
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×
Keyboard Shortcuts
Global
s
Focus search bar
?
Bring up this help dialog
GitHub
g
p
Go to pull requests
g
i
go to github issues (only if github is preferred repository)
POD
g
a
Go to author
g
c
Go to changes
g
i
Go to issues
g
d
Go to dist
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r
Go to repository/SCM
g
s
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(e.g.
distribution:Dancer auth
)
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author:SONGMU Redis
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(e.g.
version:1.00
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